 |
Мир РНК как предшественник современной жизни
|
|
|
|
Министерство высшего и среднего специального образования Российской Федерации
Волгоградский государственный технический университет
Кафедра органической химии
КУРСОВАЯ РАБОТА
по теме: «Химия наследственности. Нуклеиновые кислоты. ДНК. РНК. Репликация ДНК и передача наследственной информации.»
Выполнил: студентка ХХХХХ
Группа ХХХХХХ
Проверил: ХХХХХХ
Волгоград - 2003
СОДЕРЖАНИЕ
| 1.ВВЕДЕНИЕ | 2 |
| 2.ПРОИСХОЖДЕНИЕ ЖИЗНИ | 3 |
| 2.1.Мир РНК как предшественник современной жизни | 4 |
| 2.2.Возникновение биосинтеза белка | 7 |
| 3.НУКЛЕИНОВЫЕ КИСЛОТЫ | 10 |
| 3.1.Состав нуклеиновых кислот | 10 |
| 3.2.Значение нуклеиновых кислот | 12 |
| 4.ДНК | 13 |
| 4.1.Состав ДНК | 13 |
| 4.2.Макромолекулярная структура ДНК | 14 |
| 4.3.Выделение дезоксирибонуклеиновых кислот | 15 |
| 4.4.Фракционирование | 16 |
| 4.5.Функции ДНК | 17 |
| 5.РНК | 18 |
| 5.1.Состав РНК | 18 |
| 5.2.Макромолекулярная структура РНК | 18 |
| 5.3.Мультифункциональность РНК | 20 |
| 5.4.Выделение рибонуклеиновых кислот | 21 |
| 5.5.Фракционирование | 22 |
| 6.ПРИРОДА МЕЖНУКЛЕОТИДНЫХ СВЯЗЕЙ | 25 |
| 6.1.Межнуклеотидная связь в ДНК | 26 |
| 6.2.Межнуклеотидная связь в РНК | 28 |
| 7.МАТРИЧНЫЙ СИНТЕЗ ДНК | 30 |
| 7.1.ДНК-полимеразы | 31 |
| 7.2.Точность синтеза ДНК и механизм коррекции | 31 |
| 8.ОСНОВНЫЕ ПРИНЦИПЫ РЕПЛИКАЦИИ | 33 |
| 8.1.Инициация цепей ДНК | 33 |
| 8.2.Расплетение двойной спирали ДНК | 34 |
| 8.3.Прерывистый синтез ДНК | 35 |
| 8.4.Кооперативное действие белков репликационной вилки | 36 |
| 8.5.Согласованность процессов репликации ДНК и клеточного деления | 36 |
| 9.ЗАКЛЮЧЕНИЕ | 38 |
| 10.СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ | 39 |
ВВЕДЕНИЕ
Мы рождаемся, взрослеем, у нас появляются дети и внуки. Мы ни одни живые существа на этой планете, вокруг нас ежечасно, ежесекундно происходит зарождение новой жизни. Этот процесс не прерывается никогда. Наши соседи по планете – это миллиарды живых существ: растения, животные, микроорганизмы, вирусы. Нас радует цветущий вишневый сад и шорох желтеющей, отмирающей листвы под ногами, умиротворяет выпрыгивающие из воды дельфины и прыгающая белка – летяга. Все мы когда - либо болели гриппом, краснухой и эти болезни вызваны нахождением в нашем организме болезнетворных микробов и вирусов, а это тоже живые организмы. Как редко мы задумываемся, откуда такое разнообразие жизни, и ее форм, так не похожих друг на друга! А между тем все живые организмы состоят из одних и тех же химических элементов, объединенных в макромолекы, такие как белки. Только у различных живых существ белки различны по своей структуре. Но почему клетки определенного организма синтезируют только свойственные им белки? Как происходит механизм передачи наследственной информации, а главное – где она хранится? Все эти вопросы перетекают в еще более важный, интересный и глобальный: жизнь – как она появилась на этой планете и как происходит ее воспроизведение? Это вопросы, на которые я постараюсь найти ответы в этой работе.
|
|
|
2. ПРОИСХОЖДЕНИЕ ЖИЗНИ
Пожалуй, первая научная, хорошо продуманная теория происхождения жизни абиогенным путем была предложена биохимиком А.И. Опариным еще в 20-х годах прошлого века. Теория базировалась на представлении, что все начиналось с белков, и на возможности в определенных условиях спонтанного химического синтеза мономеров белков - аминокислот - и белковоподобных полимеров (полипептидов) абиогенным путем. Публикация теории стимулировала многочисленные эксперименты в ряде лабораторий мира, показавшие реальность такого синтеза в искусственных условиях. Теория быстро стала общепринятой и необыкновенно популярной.
|
|
|
Основным ее постулатом было то, что спонтанно возникавшие в первичном "бульоне" белковоподобные соединения объединялись в коацерватные капли - обособленные коллоидные системы, плавающие в более разбавленном водном растворе. Это давало главную предпосылку возникновения организмов - обособление некой биохимической системы от окружающей среды, ее компартментализацию. Так как некоторые белковоподобные соединения коацерватных капель могли обладать каталитической активностью, то появлялась возможность прохождения биохимических реакций синтеза внутри капель - возникало подобие ассимиляции, а значит, роста коацервата с последующим его распадом на части - размножением. Ассимилирующий, растущий и размножающийся делением коацерват рассматривался как прообраз живой клетки (рис. 1)
Все было хорошо продумано и научно обосновано в теории, кроме одной проблемы, на которую долго закрывали глаза почти все специалисты в области происхождения жизни. Если спонтанно, путем случайных безматричных синтезов в коацервате возникали единичные удачные конструкции белковых молекул (например, эффективные катализаторы, обеспечивающие преимущество данному коацервату в росте и размножении), то как они могли копироваться для распространения внутри коацервата, а тем более для передачи коацерватам-потомкам? Теория оказалась неспособной предложить решение проблемы точного воспроизведения - внутри коацервата и в поколениях - единичных, случайно появившихся эффективных белковых структур.
Рис. 1. Схематическое представление пути происхождения жизни
согласно белково - коацерватной теории А.И. Опарина
Мир РНК как предшественник современной жизни
Накопление знаний о генетическом коде, нуклеиновых кислотах и биосинтезе белков привело к утверждению принципиально новой идеи о том, что все начиналось вовсе не с белков, а с РНК. Нуклеиновые кислоты являются единственным типом биологических полимеров, макромолекулярная структура которых, благодаря принципу комплементарности при синтезе новых цепей, обеспечивает возможность копирования собственной линейной последовательности мономерных звеньев, другими словами, возможность воспроизведения (репликации) полимера, его микроструктуры. Поэтому только нуклеиновые кислоты, но не белки, могут быть генетическим материалом, то есть воспроизводимыми молекулами, повторяющими свою специфическую микроструктуру в поколениях.
|
|
|
По ряду соображений именно РНК, а не ДНК, могла представлять собой первичный генетический материал.
Во-первых, и в химическом синтезе, и в биохимических реакциях рибонуклеотиды предшествуют дезоксирибонуклеотидам; дезоксирибонуклеотиды - продукты модификации рибонуклеотидов.
Во-вторых, в самых древних, универсальных процессах жизненного метаболизма широко представлены именно рибонуклеотиды, а не дезоксирибонуклеотиды, включая основные энергетические носители типа рибонуклеозид-полифосфатов (АТФ и т.п.).
В-третьих, репликация РНК может происходить без какого бы то ни было участия ДНК, а механизм редупликации ДНК даже в современном живом мире требует обязательного участия РНК-затравки в инициации синтеза цепи ДНК.
В-четвертых, обладая всеми теми же матричными и генетическими функциями, что и ДНК, РНК способна также к выполнению ряда функций, присущих белкам, включая катализ химических реакций. Таким образом, имеются все основания рассматривать ДНК как более позднее эволюционное приобретение - как модификацию РНК, специализированную для выполнения функции воспроизведения и хранения уникальных копий генов в составе клеточного генома без непосредственного участия в биосинтезе белков.
После того как были открыты каталитически активные РНК, идея первичности РНК в происхождении жизни получила сильнейший толчок к развитию, и была сформулирована концепция самодостаточного мира РНК, предшествовавшего современной жизни. Возможная схема возникновения мира РНК представлена на рис. 2.
| Рис. 2. Схематическое представление пути происхождения жизни согласно современной концепции первичности мира РНК |
Абиогенный синтез рибонуклеотидов и их ковалентное объединение в олигомеры и полимеры типа РНК могли происходить приблизительно в тех же условиях и в той же химической обстановке, что постулировались для образования аминокислот и полипептидов. Недавно А.Б. Четверин с сотрудниками (Институт белка РАН) экспериментально показали, что по крайней мере некоторые полирибонуклеотиды (РНК) в обычной водной среде способны к спонтанной рекомбинации, то есть обмену отрезками цепи, путем транс-эстерификации. Обмен коротких отрезков цепи на длинные, должен приводить к удлинению полирибонуклеотидов (РНК), а сама подобная рекомбинация способствовать структурному многообразию этих молекул. Среди них могли возникать и каталитически активные молекулы РНК.
|
|
|
Даже крайне редкое появление единичных молекул РНК, которые были способны катализировать полимеризацию рибонуклеотидов или соединение (сплайсинг) олигонуклеотидов на комплементарной цепи как на матрице, означало становление механизма репликации РНК. Репликация самих РНК-катализаторов (рибозимов) должна была повлечь за собой возникновение самореплицирующихся популяций РНК. Продуцируя свои копии, РНК размножались. Неизбежные ошибки в копировании (мутации) и рекомбинации в самореплицирующихся популяциях РНК создавали все большее разнообразие этого мира. Таким образом, предполагаемый древний мир РНК - это "самодостаточный биологический мир, в котором молекулы РНК функционировали и как генетический материал, и как энзимоподобные катализаторы".
|
|
|
