Главная | Обратная связь | Поможем написать вашу работу!
МегаЛекции

Молек-ные мех-мы репарации (на примере устранения димеров тимимна)




1. Фотореактивация

2. Эксцизионная репарация

3. Пострепликативная (рекомбинационная) репарация

4. SOS – репарация

1. Фотореактивация – откр нем уч Рупертом в 1962г., протек при участии особых фер-в фотолиаз; дезоксирибопиримедининфотолиаза (ДРФ).

Особенности данного типа репар: для работы треб-ся Е видимого света в диапозоне длины волны ƛ = 300 – 600 нм.

Схема фотореактивации

1. узнование фер-том димера тимина

2. Расшивание димеров тимина, освобожд фер-тов.

У бактерий, животных, человека.

 

2. Эксцизионная репар. Происх от лат excision - резать, вырезать – протек по механ «режь и латай». Для данного типа репар треб работа множест-х фер-тов.

Основные этапы:

 

 

1. Надрезание одной из нитей ДНК в обл –ти расп димеров тимина, со стороны 5’ конца. Образование однонитиевого разрыва в ДНК. Ф-т эндонуклеаза.

2. Вырезание однонитевого фрагмента ДНК содерж димер тимина в напр 5’ – 3’ – обр-е бреши.

3. Застраив бреши в ДНК по принципу комплиментарности на осн нити бреши до 15 тыс нуклеотидов. Экзонуклеаза ферм.

- ДНК полимераза 1 (застр бреши до 30 нукл)

- ДНК полимераза 2 (от 30 до 15 тыс нукл)

4. Соедин свободных концов ДНК обр-щихся при застр-и бреши. Ф-т Лигаза

Скорость эксцизионной репар в кл 40 тыс дим в час.

3.Пострепликативная (комбинационная) репар. В ее осущ уч мех-змы реплик и рекомб ДНК.

Рекомбинация – процесс обмена уч-ми между мол-ми ДНК.

Таким обр при данном типе репар-ии часть мо-л ДНК остается поврежденными, поэтому репарацию называют «Репарация, склонная к ошибкам».

SOS – репарация. Откр Радмоном в 1974г., ее проводит сист фер-тов, кот нет в обыч кл и формир кот редуцир внеш возд (высок темп, УФ-излуч). Такие белки фер-ты наз. «шоковые белки». Система сос репар вкл тогда, когда поврежд ДНК стан настолько много, что они угрожают жизни кл. В сист сос репар играет 2 белка: - Rec A белок, Lex A белок.

Схема вкл сос-репар: повреждающее возд (выс темп) -> активация действия Rec A -> расщепление белка репроссора Lex A -> индукция под действием Lex A работы различ фер-в.

СОС-репар осущ путем ув интенсивности экстезионной и рекомб репар.

Наруш репар могут прив к наследств заболев: пигментная ксеродерма (XP не может находится на свету). 3 осн формы:

XP I – наруш активн у УФ излуч

XP II – наруш ДНК полимеразы

XP rar – наруш пострепликативной репар.


 

Секвенирование ДНК. Методы Максама-Гилберта и Сенгера. Проект «Геном человека».

Секвенирование -это определение послед-ти распол-я нуклеотидов ДНК.

Разраб. 2 основн. метода секвенир-я:

1) Хим. метод – разраб. А. Максомам и У. Гибертом в 1976 г.

2) Ферментативный метод – разраб. Ф. Сенгером в 1975 г.

Метод секвенир. позвол. опред. нуклеотидн. последоват. фрагментов ДНК, длинной 150-300 п.н. Поэтому перед секвенир. ДНК предварительно разрез. на фрагменты, котор. хранятся в банке генов. После секвенир. его рез-ты для разных фрагментов объед. в единое целое и получ. полную нуклеотидную последовательность ДНК.

Метод Максама-Гилберта:

 

 

 

Обработка содержимого пробирок спец. реактивами, разруш. ДНК по отдельным нуклеотидам (в условиях дефицита этих реактивов)


По А

образ. набор фрагментов

32Р – 1 нуклеотид

32Р АГЦТ – 5 нуклеотидов

32Р АГЦТАГТЦТ– 10 нуклеотидов

По Г

образ. набор фрагментов

32Р А – 2 нуклеотида

32Р АГЦТА – 6 нуклеотидов

32Р АГЦТАГТЦТА–11 нуклеотидов

 

По Т

образ. набор фрагментов

32Р АГЦ – 4 нуклеотида

32Р АГЦТАГ – 7 нуклеотидов

32Р АГЦТАГТЦ–9 нуклеотидов

 

 

По Ц

образ. набор фрагментов

32Р АГ – 3 нуклеотида

32Р АГЦТАГТ – 8 нуклеотидов

32Р АГЦТАГТЦТАГ –12 нуклеотидов



калибровочная дорожка, отраж. число нуклеотидов


Чтение электрофолаграмы осущ. от + к - (снизу вверх).

+ соответствует 5’-концу фрагмента ДНК.

5’ АГЦТАГТЦТАГЦ 3’

 

Поделиться:





Воспользуйтесь поиском по сайту:



©2015 - 2024 megalektsii.ru Все авторские права принадлежат авторам лекционных материалов. Обратная связь с нами...