Молек-ные мех-мы репарации (на примере устранения димеров тимимна)
1. Фотореактивация 2. Эксцизионная репарация 3. Пострепликативная (рекомбинационная) репарация 4. SOS – репарация 1. Фотореактивация – откр нем уч Рупертом в 1962г., протек при участии особых фер-в фотолиаз; дезоксирибопиримедининфотолиаза (ДРФ). Особенности данного типа репар: для работы треб-ся Е видимого света в диапозоне длины волны ƛ = 300 – 600 нм. Схема фотореактивации 1. узнование фер-том димера тимина 2. Расшивание димеров тимина, освобожд фер-тов. У бактерий, животных, человека.
2. Эксцизионная репар. Происх от лат excision - резать, вырезать – протек по механ «режь и латай». Для данного типа репар треб работа множест-х фер-тов. Основные этапы:
1. Надрезание одной из нитей ДНК в обл –ти расп димеров тимина, со стороны 5’ конца. Образование однонитиевого разрыва в ДНК. Ф-т эндонуклеаза. 2. Вырезание однонитевого фрагмента ДНК содерж димер тимина в напр 5’ – 3’ – обр-е бреши. 3. Застраив бреши в ДНК по принципу комплиментарности на осн нити бреши до 15 тыс нуклеотидов. Экзонуклеаза ферм. - ДНК полимераза 1 (застр бреши до 30 нукл) - ДНК полимераза 2 (от 30 до 15 тыс нукл) 4. Соедин свободных концов ДНК обр-щихся при застр-и бреши. Ф-т Лигаза Скорость эксцизионной репар в кл 40 тыс дим в час. 3.Пострепликативная (комбинационная) репар. В ее осущ уч мех-змы реплик и рекомб ДНК. Рекомбинация – процесс обмена уч-ми между мол-ми ДНК. Таким обр при данном типе репар-ии часть мо-л ДНК остается поврежденными, поэтому репарацию называют «Репарация, склонная к ошибкам». SOS – репарация. Откр Радмоном в 1974г., ее проводит сист фер-тов, кот нет в обыч кл и формир кот редуцир внеш возд (высок темп, УФ-излуч). Такие белки фер-ты наз. «шоковые белки». Система сос репар вкл тогда, когда поврежд ДНК стан настолько много, что они угрожают жизни кл. В сист сос репар играет 2 белка: - Rec A белок, Lex A белок.
Схема вкл сос-репар: повреждающее возд (выс темп) -> активация действия Rec A -> расщепление белка репроссора Lex A -> индукция под действием Lex A работы различ фер-в. СОС-репар осущ путем ув интенсивности экстезионной и рекомб репар. Наруш репар могут прив к наследств заболев: пигментная ксеродерма (XP не может находится на свету). 3 осн формы: XP I – наруш активн у УФ излуч XP II – наруш ДНК полимеразы XP rar – наруш пострепликативной репар.
Секвенирование ДНК. Методы Максама-Гилберта и Сенгера. Проект «Геном человека». Секвенирование -это определение послед-ти распол-я нуклеотидов ДНК. Разраб. 2 основн. метода секвенир-я: 1) Хим. метод – разраб. А. Максомам и У. Гибертом в 1976 г. 2) Ферментативный метод – разраб. Ф. Сенгером в 1975 г. Метод секвенир. позвол. опред. нуклеотидн. последоват. фрагментов ДНК, длинной 150-300 п.н. Поэтому перед секвенир. ДНК предварительно разрез. на фрагменты, котор. хранятся в банке генов. После секвенир. его рез-ты для разных фрагментов объед. в единое целое и получ. полную нуклеотидную последовательность ДНК. Метод Максама-Гилберта:
Обработка содержимого пробирок спец. реактивами, разруш. ДНК по отдельным нуклеотидам (в условиях дефицита этих реактивов) По А образ. набор фрагментов 32Р – 1 нуклеотид 32Р АГЦТ – 5 нуклеотидов 32Р АГЦТАГТЦТ– 10 нуклеотидов По Г образ. набор фрагментов 32Р А – 2 нуклеотида 32Р АГЦТА – 6 нуклеотидов 32Р АГЦТАГТЦТА–11 нуклеотидов
По Т образ. набор фрагментов 32Р АГЦ – 4 нуклеотида 32Р АГЦТАГ – 7 нуклеотидов 32Р АГЦТАГТЦ–9 нуклеотидов
По Ц образ. набор фрагментов 32Р АГ – 3 нуклеотида 32Р АГЦТАГТ – 8 нуклеотидов 32Р АГЦТАГТЦТАГ –12 нуклеотидов
калибровочная дорожка, отраж. число нуклеотидов Чтение электрофолаграмы осущ. от + к - (снизу вверх). + соответствует 5’-концу фрагмента ДНК. 5’ АГЦТАГТЦТАГЦ 3’
Воспользуйтесь поиском по сайту: ©2015 - 2024 megalektsii.ru Все авторские права принадлежат авторам лекционных материалов. Обратная связь с нами...
|